El Škoda Octavia WRC Evo3 fue la última evolución del modelo, estrenada en Finlandia en 2002 con mejoras en el chasis, la aerodinámica y la gestión del motor. Montaba un motor turbo de dos litros y unos 300 CV, con tracción en las cuatro ruedas. En el año 2003 Didier Auriol y Denis Giraudet obtuvieron la novena posición en el Rallye de Monte-Carlo pilotando un Škoda Octavia WRC Evo3 del equipo Škoda Motorsport. Altaya reprodujo este coche para su modelo de la colección PRO. Ese mismo año, el equipo oficial comenzó a sustituirlo por el nuevo Fabia WRC.