El Škoda Fabia WRC debutó en 2003 en el Campeonato del Mundo de Rally (WRC), sustituyendo al Octavia WRC. Montaba un motor 2.0 turbo de cuatro cilindros limitado a unos 300 CV, tracción total y caja secuencial, conforme a la normativa World Rally Car de la época. François Duval y Patrick Pivato participaron en el Rally de Monte-Carlo de 2006 con un Skoda Fabia, aunque no pudieron acabar debido a un accidente en SS9. Tecnitoys se inspiró en este coche para su modelo 6459.