El Škoda Octavia WRC Evo3 va ser l’última evolució del model, estrenada a Finlàndia el 2002 amb millores en el xassís, l’aerodinàmica i la gestió del motor. Muntava un motor turbo de dos litres i uns 300 CV, amb tracció a les quatre rodes. El 2003 Didier Auriol i Denis Giraudet van obtenir la novena posició al Ral·li de Montecarlo amb un Škoda Octavia WRC Evo3 de l’equip Škoda Motorsport. Altaya va reproduir aquest cotxe per al seu model de la col·lecció PRO. Aquell mateix any, l’equip oficial va començar a substituir-lo pel nou Fabia WRC.