En l'any 2000 va arribar l'Evo 3, que refinava el Córdoba WRC amb millores en la distribució de pesos, electrònica i aerodinámica, mantenint els 300 CV reglamentaris però guanyant en fiabilitat i equilibri. El famós pilot de motociclisme Àlex Crivillé en la seva incursió en el món del Rally juntament amb Kini Muntada van aconseguir un tercer lloc en la 8ª Ral·li de Terra Quatre Rodes - Ciutat de Figueres de 2006 pilotant un Seat Córdoba WRC Evo3. Aquest cotxe va servir de model a Tecnitoys per a la seva referència 6249.